Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms