Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNI2Q6ZMN8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms