Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI9

NPNT, Nephronectin, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPNTQ6UXI9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPNTQ6UXI9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPNTQ6UXI9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPNTQ6UXI9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPNTQ6UXI9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPNTQ6UXI9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NPNTQ6UXI9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NPNTQ6UXI9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NPNTQ6UXI9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPNTQ6UXI9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NPNTQ6UXI9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NPNTQ6UXI9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPNTQ6UXI9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPNTQ6UXI9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPNTQ6UXI9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPNTQ6UXI9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPNTQ6UXI9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NPNTQ6UXI9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPNTQ6UXI9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NPNTQ6UXI9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPNTQ6UXI9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPNTQ6UXI9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NPNTQ6UXI9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPNTQ6UXI9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NPNTQ6UXI9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPNTQ6UXI9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPNTQ6UXI9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPNTQ6UXI9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPNTQ6UXI9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPNTQ6UXI9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPNTQ6UXI9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPNTQ6UXI9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPNTQ6UXI9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPNTQ6UXI9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPNTQ6UXI9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPNTQ6UXI9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPNTQ6UXI9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPNTQ6UXI9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPNTQ6UXI9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPNTQ6UXI9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPNTQ6UXI9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPNTQ6UXI9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPNTQ6UXI9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPNTQ6UXI9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms