Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZBED9Q6R2W3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms