Protein–RNA interactions for Protein: Q6H8Q1

ABLIM2, Actin-binding LIM protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABLIM2Q6H8Q1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABLIM2Q6H8Q1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABLIM2Q6H8Q1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms