Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GGNBP1Q5YKI7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GGNBP1Q5YKI7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GGNBP1Q5YKI7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GGNBP1Q5YKI7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GGNBP1Q5YKI7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GGNBP1Q5YKI7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GGNBP1Q5YKI7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GGNBP1Q5YKI7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GGNBP1Q5YKI7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GGNBP1Q5YKI7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GGNBP1Q5YKI7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GGNBP1Q5YKI7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GGNBP1Q5YKI7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GGNBP1Q5YKI7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GGNBP1Q5YKI7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GGNBP1Q5YKI7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GGNBP1Q5YKI7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GGNBP1Q5YKI7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GGNBP1Q5YKI7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GGNBP1Q5YKI7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GGNBP1Q5YKI7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GGNBP1Q5YKI7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GGNBP1Q5YKI7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GGNBP1Q5YKI7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GGNBP1Q5YKI7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GGNBP1Q5YKI7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GGNBP1Q5YKI7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GGNBP1Q5YKI7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GGNBP1Q5YKI7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms