Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5Y3

CAMSAP1, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP1Q5T5Y3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CAMSAP1Q5T5Y3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CAMSAP1Q5T5Y3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CAMSAP1Q5T5Y3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CAMSAP1Q5T5Y3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CAMSAP1Q5T5Y3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
CAMSAP1Q5T5Y3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CAMSAP1Q5T5Y3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms