Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PDSS1Q5T2R2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms