Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LDLRAP1Q5SW96 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms