Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms