Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms