Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDO1Q16878 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDO1Q16878 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
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