Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LY6EQ16553 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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