Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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