Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SIX1Q15475 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
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