Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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