Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM25Q14258 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM25Q14258 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM25Q14258 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM25Q14258 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM25Q14258 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM25Q14258 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM25Q14258 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM25Q14258 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM25Q14258 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM25Q14258 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM25Q14258 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM25Q14258 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM25Q14258 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM25Q14258 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM25Q14258 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM25Q14258 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM25Q14258 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM25Q14258 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM25Q14258 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM25Q14258 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM25Q14258 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM25Q14258 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM25Q14258 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM25Q14258 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM25Q14258 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM25Q14258 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM25Q14258 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRIM25Q14258 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM25Q14258 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
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