Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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