Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CHAF1BQ13112 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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