Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM32Q13049 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
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