Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms