Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DSC1Q08554 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms