Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CACNG1Q06432 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms