Protein–RNA interactions for Protein: Q04304

YMR090W, UPF0659 protein YMR090W, yeast

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR090W	Q04304	RPO21	YDL140C	5202 nt		3.44	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	ELO2	YCR034W	1044 nt		3.44	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	FMP46	YKR049C	402 nt		3.44	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	YML031C-A	YML031C-A	336 nt		3.44	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	HEK2	YBL032W	1146 nt		3.44	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	HEM15	YOR176W	1182 nt		3.44	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	HSP26	YBR072W	645 nt		3.44	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	GDT1	YBR187W	843 nt		3.44	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	MCP2	YLR253W	1710 nt		3.44	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	SMF1	YOL122C	1728 nt		3.44	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	TAF12	YDR145W	1620 nt		3.44	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	MET3	YJR010W	1536 nt		3.44	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	FPK1	YNR047W	2682 nt		3.43	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	PTC1	YDL006W	846 nt		3.43	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	RPC53	YDL150W	1269 nt		3.43	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	AAD6	YFL056C	639 nt		3.43	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	EFB1	YAL003W	621 nt		3.43	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	YLR374C	YLR374C	390 nt		3.43	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	AST1	YBL069W	1290 nt		3.43	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	YBR139W	YBR139W	1527 nt		3.43	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	NUP133	YKR082W	3474 nt		3.42	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	RAM1	YDL090C	1296 nt		3.42	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	RPS11A	YDR025W	471 nt		3.42	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	SPC19	YDR201W	498 nt		3.42	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	CNB1	YKL190W	528 nt		3.42	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	KTR2	YKR061W	1278 nt		3.42	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	YMR114C	YMR114C	1107 nt		3.42	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	RCL1	YOL010W	1104 nt		3.42	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	PHM7	YOL084W	2976 nt		3.42	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	UTP23	YOR004W	765 nt		3.42	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	SRO7	YPR032W	3102 nt		3.42	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	MTR10	YOR160W	2919 nt		3.42	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	ACE2	YLR131C	2313 nt		3.41	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	RPS13	YDR064W	456 nt		3.41	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	YDR274C	YDR274C	372 nt		3.41	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	FRA2	YGL220W	363 nt		3.41	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	YLF2	YHL014C	1218 nt		3.41	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	YMR082C	YMR082C	357 nt		3.41	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	YMR130W	YMR130W	909 nt		3.41	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	RGS2	YOR107W	930 nt		3.41	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	TCO89	YPL180W	2400 nt		3.41	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	TAF7	YMR227C	1773 nt		3.4	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	NCR1	YPL006W	3513 nt		3.4	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	PRT1	YOR361C	2292 nt		3.4	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	ECM32	YER176W	3366 nt		3.4	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	HIS6	YIL020C	786 nt		3.4	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	RPL18B	YNL301C	561 nt		3.4	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	YPR071W	YPR071W	636 nt		3.4	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	YBR141W-A	YBR141W-A	96 nt		3.4	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	PIM1	YBL022C	3402 nt		3.4	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	HCM1	YCR065W	1695 nt		3.39	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	SUL2	YLR092W	2682 nt		3.39	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	SSH4	YKL124W	1740 nt		3.39	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	MLH2	YLR035C	2088 nt		3.39	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	COX4	YGL187C	468 nt		3.39	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	IRC9	YJL142C	393 nt		3.39	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	LDB18	YLL049W	540 nt		3.39	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	SPS18	YNL204C	903 nt		3.39	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	REX4	YOL080C	870 nt		3.39	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	YBR056W-A	YBR056W-A	201 nt		3.39	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	TRM11	YOL124C	1302 nt		3.39	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	MLF3	YNL074C	1359 nt		3.38	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	RPP1A	YDL081C	321 nt		3.38	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	NOP13	YNL175C	1212 nt		3.38	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	RPS19A	YOL121C	435 nt		3.38	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	RRP40	YOL142W	723 nt		3.38	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	MGR2	YPL098C	342 nt		3.38	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	YPR174C	YPR174C	666 nt		3.38	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	DPH6	YLR143W	2058 nt		3.38	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	BIK1	YCL029C	1323 nt		3.38	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	SKM1	YOL113W	1968 nt		3.38	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	IDS2	YJL146W	1410 nt		3.37	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	ALG9	YNL219C	1668 nt		3.37	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	RTA1	YGR213C	954 nt		3.37	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	MHO1	YJR008W	1017 nt		3.37	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	RFC2	YJR068W	1062 nt		3.37	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	URE2	YNL229C	1065 nt		3.37	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	RSC3	YDR303C	2658 nt		3.37	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	ZRC1	YMR243C	1329 nt		3.37	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	MCM2	YBL023C	2607 nt		3.37	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	RCM1	YNL022C	1473 nt		3.36	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	SPT23	YKL020C	3249 nt		3.36	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	YER076C	YER076C	909 nt		3.36	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	YHR095W	YHR095W	495 nt		3.36	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	GVP36	YIL041W	981 nt		3.36	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	SRP40	YKR092C	1221 nt		3.36	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	OPT2	YPR194C	2634 nt		3.36	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	MNL1	YHR204W	2391 nt		3.36	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	KEX1	YGL203C	2190 nt		3.35	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	GIP4	YAL031C	2283 nt		3.35	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	YER034W	YER034W	558 nt		3.35	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	ADD66	YKL206C	804 nt		3.35	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	GAC1	YOR178C	2382 nt		3.35	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	SPC105	YGL093W	2754 nt		3.35	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	PPZ1	YML016C	2079 nt		3.34	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	OAF1	YAL051W	3144 nt		3.34	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	ZDS1	YMR273C	2748 nt		3.34	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	YGL108C	YGL108C	423 nt		3.34	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	REC104	YHR157W	549 nt		3.34	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	AAD10	YJR155W	867 nt		3.34	□□□□□ -1.87

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 52.4 ms