Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFHR1Q03591 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms