Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms