Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms