Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TFAMQ00059 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms