Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms