Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms