Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms