Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms