Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPARGP37231 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPARGP37231 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPARGP37231 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPARGP37231 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPARGP37231 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPARGP37231 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPARGP37231 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPARGP37231 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPARGP37231 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PPARGP37231 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PPARGP37231 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPARGP37231 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPARGP37231 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPARGP37231 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPARGP37231 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPARGP37231 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPARGP37231 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPARGP37231 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPARGP37231 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPARGP37231 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPARGP37231 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPARGP37231 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPARGP37231 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPARGP37231 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPARGP37231 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PPARGP37231 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPARGP37231 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPARGP37231 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPARGP37231 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPARGP37231 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPARGP37231 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPARGP37231 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPARGP37231 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPARGP37231 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPARGP37231 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PPARGP37231 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPARGP37231 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPARGP37231 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPARGP37231 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPARGP37231 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPARGP37231 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPARGP37231 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPARGP37231 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPARGP37231 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPARGP37231 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPARGP37231 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPARGP37231 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPARGP37231 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPARGP37231 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPARGP37231 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PPARGP37231 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPARGP37231 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPARGP37231 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPARGP37231 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPARGP37231 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPARGP37231 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PPARGP37231 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPARGP37231 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPARGP37231 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPARGP37231 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPARGP37231 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPARGP37231 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPARGP37231 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPARGP37231 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPARGP37231 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPARGP37231 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPARGP37231 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPARGP37231 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPARGP37231 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPARGP37231 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPARGP37231 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPARGP37231 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPARGP37231 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPARGP37231 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPARGP37231 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPARGP37231 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPARGP37231 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPARGP37231 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPARGP37231 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPARGP37231 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPARGP37231 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPARGP37231 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPARGP37231 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPARGP37231 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPARGP37231 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPARGP37231 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARGP37231 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARGP37231 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARGP37231 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARGP37231 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARGP37231 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARGP37231 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARGP37231 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARGP37231 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARGP37231 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARGP37231 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARGP37231 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARGP37231 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARGP37231 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms