Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN4AP35499 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN4AP35499 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN4AP35499 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN4AP35499 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN4AP35499 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN4AP35499 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN4AP35499 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN4AP35499 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN4AP35499 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN4AP35499 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN4AP35499 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN4AP35499 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN4AP35499 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN4AP35499 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN4AP35499 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN4AP35499 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN4AP35499 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN4AP35499 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN4AP35499 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN4AP35499 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN4AP35499 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN4AP35499 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN4AP35499 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN4AP35499 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN4AP35499 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN4AP35499 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN4AP35499 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN4AP35499 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN4AP35499 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN4AP35499 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN4AP35499 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN4AP35499 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN4AP35499 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN4AP35499 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SCN4AP35499 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCN4AP35499 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms