Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNB1P35222 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CTNNB1P35222 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms