Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms