Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCKSP29966 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms