Protein–RNA interactions for Protein: P29373

CRABP2, Cellular retinoic acid-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP2P29373 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRABP2P29373 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRABP2P29373 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms