Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMA1P25786 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMA1P25786 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMA1P25786 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMA1P25786 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMA1P25786 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMA1P25786 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms