Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 PSMC4-204ENST00000596386 929 ntTSL 215.04■□□□□ -04e-11■■■■■ 32.6
RPS3P23396 G6PD-204ENST00000433845 817 ntTSL 314.66□□□□□ -0.064e-7■■■■■ 32.6
RPS3P23396 PSMC4-203ENST00000593455 1532 ntTSL 514.59□□□□□ -0.074e-11■■■■■ 32.6
RPS3P23396 FPGS-206ENST00000431857 959 ntTSL 514.22□□□□□ -0.134e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 ABHD10-202ENST00000491580 1339 ntTSL 214.19□□□□□ -0.144e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 CLUH-214ENST00000576885 583 ntTSL 314.13□□□□□ -0.154e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 ABHD10-205ENST00000497293 724 ntTSL 214.04□□□□□ -0.164e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 ABHD10-203ENST00000493784 890 ntTSL 314.04□□□□□ -0.164e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.174e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 CS-229ENST00000551936 744 ntTSL 313.94□□□□□ -0.189e-7■■■■■ 32.6
RPS3P23396 PSMC4-205ENST00000601194 650 ntTSL 313.93□□□□□ -0.184e-11■■■■■ 32.6
RPS3P23396 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 PSMC4-206ENST00000601697 1623 ntTSL 213.9□□□□□ -0.194e-11■■■■■ 32.6
RPS3P23396 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 UBE2L3-203ENST00000496722 3451 ntTSL 213.69□□□□□ -0.221e-9■■■■■ 32.6
RPS3P23396 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.224e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 MRPL21-204ENST00000541265 555 ntTSL 413.58□□□□□ -0.244e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.244e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 HINT2-207ENST00000490578 717 ntTSL 213.55□□□□□ -0.244e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 HDAC1-206ENST00000476391 2409 ntTSL 1 (best)13.52□□□□□ -0.253e-9■■■■■ 32.6
RPS3P23396 MRPL36-201ENST00000382647 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.264e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.274e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 PPP1R8-201ENST00000236412 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.284e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.34e-11■■■■■ 32.6
RPS3P23396 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.334e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 HDAC1-208ENST00000482310 779 ntTSL 512.99□□□□□ -0.335e-9■■■■■ 32.6
RPS3P23396 DNPEP-209ENST00000457935 1091 ntTSL 512.95□□□□□ -0.344e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 DNPEP-220ENST00000523282 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.344e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.354e-11■■■■■ 32.6
RPS3P23396 DNPEP-210ENST00000460963 1610 ntTSL 212.77□□□□□ -0.364e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 UBE2L3-204ENST00000545681 2932 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.371e-9■■■■■ 32.6
RPS3P23396 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.43e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 HDAC1-209ENST00000484305 561 ntTSL 512.51□□□□□ -0.415e-9■■■■■ 32.6
RPS3P23396 DNPEP-205ENST00000373972 1578 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.434e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 HDAC1-210ENST00000490081 1047 ntTSL 312.34□□□□□ -0.433e-9■■■■■ 32.6
RPS3P23396 MRPL21-203ENST00000536637 557 ntTSL 212.15□□□□□ -0.464e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 YIPF2-210ENST00000591872 430 ntTSL 212.12□□□□□ -0.474e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 UBE2L3-201ENST00000342192 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.471e-9■■■■■ 32.6
RPS3P23396 ALAS1-201ENST00000310271 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.494e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 CLUH-204ENST00000571566 545 ntTSL 411.92□□□□□ -0.54e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 PPP1R8-204ENST00000431586 1029 ntTSL 311.67□□□□□ -0.544e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 DNPEP-219ENST00000522421 582 ntTSL 311.58□□□□□ -0.564e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 LAMTOR2-203ENST00000368305 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.564e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 LAMTOR2-206ENST00000489664 868 ntTSL 211.43□□□□□ -0.584e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 ALAS1-202ENST00000394965 2430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.584e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 TM2D3-208ENST00000559891 2133 ntTSL 1 (best)11.36□□□□□ -0.594e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 ARHGAP1-204ENST00000526423 1377 ntTSL 1 (best)11.26□□□□□ -0.614e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 TM2D3-215ENST00000561373 1734 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.624e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 CS-221ENST00000550734 747 ntTSL 511.14□□□□□ -0.639e-7■■■■■ 32.6
RPS3P23396 UBE2L3-202ENST00000458578 3007 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.631e-9■■■■■ 32.6
RPS3P23396 TM2D3-202ENST00000347970 1329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.654e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 MRPL21-201ENST00000362034 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.654e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 BNIP3L-203ENST00000520077 922 ntTSL 1 (best)10.84□□□□□ -0.673e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 PEPD-213ENST00000609145 570 ntTSL 210.77□□□□□ -0.694e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 SGPL1-202ENST00000373202 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.712e-67■■■■■ 32.6
RPS3P23396 KIF2C-202ENST00000372224 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.714e-7■■■■■ 32.6
RPS3P23396 ALAS1-205ENST00000484952 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.724e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 LAMTOR2-201ENST00000368302 587 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.724e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 NUP93-206ENST00000563465 458 ntTSL 210.18□□□□□ -0.784e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 LAMTOR2-202ENST00000368304 521 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.794e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 MRPL21-205ENST00000541279 764 ntTSL 510.08□□□□□ -0.84e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 IDH3B-205ENST00000466999 521 ntTSL 210.07□□□□□ -0.87e-10■■■■■ 32.6
RPS3P23396 TM2D3-203ENST00000428002 1267 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.84e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 ADH4-201ENST00000265512 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.874e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 TM2D3-204ENST00000558129 864 ntTSL 39.6□□□□□ -0.874e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 ARHGAP1-206ENST00000528837 1000 ntTSL 59.42□□□□□ -0.94e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 MRPL21-202ENST00000450904 662 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.924e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 KIF2C-201ENST00000372217 2955 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.925e-7■■■■■ 32.6
RPS3P23396 PEPD-205ENST00000588719 484 ntTSL 39.01□□□□□ -0.974e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 ACAA1-210ENST00000451419 964 ntTSL 39.01□□□□□ -0.974e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 BNIP3L-207ENST00000523949 875 ntTSL 38.76□□□□□ -1.014e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 EP400-205ENST00000389562 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.034e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 NUP93-218ENST00000569322 410 ntTSL 38.62□□□□□ -1.034e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 EP400-204ENST00000389561 12317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.034e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 CS-211ENST00000548041 561 ntTSL 48.42□□□□□ -1.069e-7■■■■■ 32.6
RPS3P23396 ADH4-209ENST00000508393 2151 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.094e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 CS-206ENST00000546930 568 ntTSL 48.16□□□□□ -1.19e-7■■■■■ 32.6
RPS3P23396 ADH4-211ENST00000512499 946 ntTSL 58.09□□□□□ -1.114e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 ADH4-204ENST00000504125 665 ntTSL 58.07□□□□□ -1.124e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 CS-216ENST00000549221 553 ntTSL 48.05□□□□□ -1.129e-7■■■■■ 32.6
RPS3P23396 LAP3-202ENST00000503467 1709 ntTSL 27.94□□□□□ -1.144e-11■■■■■ 32.6
RPS3P23396 ARHGAP1-201ENST00000311956 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.154e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 ABHD10-204ENST00000494817 801 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.224e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 ADH4-202ENST00000503416 708 ntTSL 27.4□□□□□ -1.224e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 GSTM3-206ENST00000540225 678 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.224e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 PEPD-208ENST00000590731 557 ntTSL 47.26□□□□□ -1.254e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 AC013489.1-201ENST00000561140 598 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.254e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 EFTUD2-208ENST00000587914 562 ntTSL 47.14□□□□□ -1.272e-8■■■■■ 32.6
RPS3P23396 ADH4-212ENST00000629236 1974 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.284e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 ADH4-208ENST00000506705 1340 ntTSL 56.89□□□□□ -1.314e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 ADH4-206ENST00000504894 489 ntTSL 56.81□□□□□ -1.324e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 CS-225ENST00000551253 676 ntTSL 36.72□□□□□ -1.331e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 HINT2-203ENST00000471774 443 ntTSL 36.57□□□□□ -1.364e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.384e-7■■■■■ 32.6
RPS3P23396 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.384e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 LAP3-209ENST00000513105 626 ntTSL 36.43□□□□□ -1.384e-11■■■■■ 32.6
RPS3P23396 NUP93-209ENST00000564278 588 ntTSL 26.14□□□□□ -1.434e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 GSTM3-204ENST00000486823 783 ntTSL 26.06□□□□□ -1.444e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 PPP1R8-205ENST00000486634 459 ntTSL 35.79□□□□□ -1.484e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.514e-6■■■■■ 32.6
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