Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ABCB4P21439 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCB4P21439 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCB4P21439 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCB4P21439 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCB4P21439 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCB4P21439 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCB4P21439 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCB4P21439 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCB4P21439 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms