Protein–RNA interactions for Protein: P18887

XRCC1, DNA repair protein XRCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC1P18887 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC1P18887 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms