Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6GP18545 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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