Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GM2AP17900 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GM2AP17900 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GM2AP17900 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GM2AP17900 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GM2AP17900 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GM2AP17900 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GM2AP17900 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GM2AP17900 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GM2AP17900 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GM2AP17900 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GM2AP17900 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GM2AP17900 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GM2AP17900 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GM2AP17900 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GM2AP17900 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GM2AP17900 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GM2AP17900 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GM2AP17900 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GM2AP17900 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GM2AP17900 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GM2AP17900 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GM2AP17900 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GM2AP17900 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GM2AP17900 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GM2AP17900 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GM2AP17900 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GM2AP17900 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GM2AP17900 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GM2AP17900 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GM2AP17900 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GM2AP17900 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GM2AP17900 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GM2AP17900 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GM2AP17900 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GM2AP17900 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GM2AP17900 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GM2AP17900 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GM2AP17900 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GM2AP17900 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GM2AP17900 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GM2AP17900 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GM2AP17900 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GM2AP17900 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GM2AP17900 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GM2AP17900 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GM2AP17900 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GM2AP17900 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GM2AP17900 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GM2AP17900 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GM2AP17900 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GM2AP17900 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GM2AP17900 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GM2AP17900 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GM2AP17900 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GM2AP17900 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GM2AP17900 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GM2AP17900 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GM2AP17900 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GM2AP17900 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GM2AP17900 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GM2AP17900 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GM2AP17900 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GM2AP17900 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GM2AP17900 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GM2AP17900 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GM2AP17900 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GM2AP17900 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GM2AP17900 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GM2AP17900 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GM2AP17900 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GM2AP17900 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GM2AP17900 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GM2AP17900 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GM2AP17900 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GM2AP17900 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GM2AP17900 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GM2AP17900 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GM2AP17900 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GM2AP17900 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GM2AP17900 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GM2AP17900 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GM2AP17900 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GM2AP17900 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GM2AP17900 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GM2AP17900 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GM2AP17900 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GM2AP17900 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GM2AP17900 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GM2AP17900 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GM2AP17900 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GM2AP17900 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GM2AP17900 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GM2AP17900 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GM2AP17900 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GM2AP17900 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GM2AP17900 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GM2AP17900 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GM2AP17900 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GM2AP17900 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms