Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GLI4P10075 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GLI4P10075 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GLI4P10075 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GLI4P10075 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GLI4P10075 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GLI4P10075 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GLI4P10075 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GLI4P10075 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GLI4P10075 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GLI4P10075 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GLI4P10075 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GLI4P10075 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GLI4P10075 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GLI4P10075 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GLI4P10075 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GLI4P10075 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GLI4P10075 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GLI4P10075 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GLI4P10075 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GLI4P10075 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GLI4P10075 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GLI4P10075 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GLI4P10075 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GLI4P10075 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GLI4P10075 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GLI4P10075 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GLI4P10075 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GLI4P10075 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GLI4P10075 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GLI4P10075 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GLI4P10075 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GLI4P10075 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GLI4P10075 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GLI4P10075 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GLI4P10075 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GLI4P10075 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GLI4P10075 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GLI4P10075 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GLI4P10075 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GLI4P10075 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GLI4P10075 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GLI4P10075 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GLI4P10075 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GLI4P10075 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GLI4P10075 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GLI4P10075 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GLI4P10075 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GLI4P10075 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GLI4P10075 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GLI4P10075 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GLI4P10075 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GLI4P10075 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GLI4P10075 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GLI4P10075 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GLI4P10075 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GLI4P10075 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLI4P10075 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLI4P10075 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLI4P10075 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLI4P10075 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLI4P10075 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLI4P10075 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLI4P10075 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLI4P10075 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLI4P10075 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLI4P10075 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLI4P10075 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLI4P10075 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLI4P10075 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GLI4P10075 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GLI4P10075 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GLI4P10075 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GLI4P10075 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GLI4P10075 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GLI4P10075 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GLI4P10075 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GLI4P10075 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GLI4P10075 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLI4P10075 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLI4P10075 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLI4P10075 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLI4P10075 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLI4P10075 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLI4P10075 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLI4P10075 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLI4P10075 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GLI4P10075 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLI4P10075 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GLI4P10075 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GLI4P10075 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLI4P10075 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLI4P10075 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLI4P10075 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLI4P10075 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLI4P10075 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GLI4P10075 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GLI4P10075 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GLI4P10075 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GLI4P10075 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms