Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms