Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIGD3P0DMS9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMIGD3P0DMS9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms