Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRCP08575 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
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