Protein–RNA interactions for Protein: P06732

CKM, Creatine kinase M-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMP06732 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKMP06732 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKMP06732 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKMP06732 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CKMP06732 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CKMP06732 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CKMP06732 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CKMP06732 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CKMP06732 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CKMP06732 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CKMP06732 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKMP06732 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKMP06732 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKMP06732 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKMP06732 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKMP06732 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKMP06732 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKMP06732 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKMP06732 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKMP06732 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKMP06732 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKMP06732 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CKMP06732 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKMP06732 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKMP06732 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKMP06732 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CKMP06732 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKMP06732 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKMP06732 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKMP06732 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKMP06732 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKMP06732 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKMP06732 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CKMP06732 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKMP06732 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKMP06732 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKMP06732 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKMP06732 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKMP06732 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKMP06732 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKMP06732 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKMP06732 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKMP06732 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKMP06732 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKMP06732 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKMP06732 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKMP06732 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKMP06732 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKMP06732 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKMP06732 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKMP06732 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKMP06732 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CKMP06732 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CKMP06732 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CKMP06732 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKMP06732 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKMP06732 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKMP06732 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKMP06732 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKMP06732 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKMP06732 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CKMP06732 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKMP06732 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKMP06732 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKMP06732 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CKMP06732 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKMP06732 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKMP06732 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CKMP06732 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKMP06732 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKMP06732 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKMP06732 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CKMP06732 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKMP06732 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKMP06732 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKMP06732 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKMP06732 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKMP06732 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKMP06732 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKMP06732 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKMP06732 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKMP06732 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKMP06732 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKMP06732 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKMP06732 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKMP06732 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKMP06732 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKMP06732 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKMP06732 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKMP06732 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKMP06732 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKMP06732 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKMP06732 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKMP06732 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKMP06732 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CKMP06732 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKMP06732 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKMP06732 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKMP06732 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKMP06732 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms