Protein–RNA interactions for Protein: O95989

NUDT3, Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT3O95989 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUDT3O95989 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUDT3O95989 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUDT3O95989 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUDT3O95989 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUDT3O95989 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUDT3O95989 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUDT3O95989 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms